Jacques Rupnik se narodil v Praze, vystudoval univerzity v Paříži-Sorbonně a na Harvardu, v současné době je výzkumným profesorem v Centru pro mezinárodní studia (CERI) na univerzitě SciencesPo v Paříži a hostujícím profesorem na College of Europe v Bruggách.
Od roku 1982, kdy nastoupil na CERI-Sciences Po, se věnuje psaní a přednášení o politice zemí východní a střední Evropy a Balkánu a jejich procesu evropské integrace. V 90. letech působil jako poradce prezidenta Václava Havla, výkonný ředitel Mezinárodní komise pro Balkán Carnegieho nadace pro mezinárodní mír (1995–1996) a byl členem Nezávislé mezinárodní komise pro Kosovo (1999–2000) a spoluautorem Zprávy o Kosovu (2000, Oxford University Press).
Mezi různé funkce, které zastával, patří také pozice poradce Evropské komise (2007–2010) či člena správní rady Institutu pro historickou spravedlnost a usmíření v Haagu (2010–2017). Působil také jako hostující profesor na několika evropských univerzitách a na Harvardu.
Mezi publikace J. Rupnika patří například následující: The Other Europe (1989, WEIDENFELD & NICOLSON), Le Printemps tchécoslovaque 1968 (1999, s úvodem Václava Havla), 1989 as a Political World Event (2014, Londýn, s úvodem Václava Havla), Géopolitique de la démocratization, l'Europe et ses voisinages, (2014, Presses de Sciences Po, Paříž), Europe at the Crossraods (2018, Knihovna Václava Havla), Senza il muro, l'Europa et il mondo dopo il crollo del communismo (2019, Donzelli, Rome).
Jeho nejnovější publikace v češtině jsou Střední Evropa je jako pták s očima vzadu (2018, Novela bohemica, Praha; cena Magnesia Litera 2019) a Josef Guttmann a osudy střední Evropy mezi Hitlerem a Stalinem (2023, ÚSTR, Praha).